印度橡胶研究所解码橡胶基因组

2021-07-02 16:31:33浏览:553次

橡胶委员会下属印度橡胶研究所解码整个橡胶克隆基因组。橡胶委员会执行董事 KN Raghavan 博士和 RRII 董事 James Jacob 博士表示,这将对旨在提高橡胶树遗传潜力以生产更多橡胶和木材的研究产生深远影响。这也将有助于进化出能够以更好的方式耐受病虫害和不利气候条件的克隆体。

 James Jacob称,RRII组装基因组信息将有助于提取有意义的生物信息,例如负责抗病、高产、TPD 耐受性、气候适应能力等的基因。在幼年阶段选择潜在高产品种的工具将在RRII的研究实验室中开发,以便农民获得性能更好的转基因橡胶植物,具有更高的产量、无过敏原的乳胶和气候适应能力。

RRII以94%的完整性完成了RRII 105基因组序列的组装草图,大小为1.47千兆碱基。基因组序列数据是通过使用Illumina、Pacbio和Roche 454等NGS平台深度测序获得的。生成的序列数据质量良好,足以覆盖橡胶基因组的200多倍。已经完成的基因组组装是印度最大的树木基因组序列之一。

目前进行橡胶基因组测序的国家有中国、马来西亚、泰国和日本。预计该项目的完成将使该国在未来几年处于橡胶种植和生产力的前沿。RRII已经在对这些方面进行研究。

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